Yo el único motivo por el cual entendería lo que te dice el cardiólogo es que, durante el ejercicio, entres nuevamente en FA rápida y que eso te suponga tener un síncope, dichos síncopes se pueden producir (aunque es cierto que en jóvenes es menos frecuente) porque tu cuerpo está requiriendo un trabajo X a tu corazón para mantener su funcionamiento (muscular, respiratorio, neurológico, etc) y si, bruscamente, ese gasto se ve disminuído de repente, la pérdida de conocimiento puede ocurrir, y ocurre sin avisar, son síncopes repentinos, que si lo tienes en el agua. De todos modos, entiendo que si te hicieron una ablación es porque esa FA ha sido producida por un haz anómalo que se ha solucionado, y la probabilidad que vuelva a ocurrirte es baja. Fuera de eso, no tendrías porque tener problemas para nadar nuevamente.
Mi recomendación: espera a finalizar el tratamiento antiarrítmico, haz ejercicio moderado fuera del agua, incluso me atrevería a decirte que nades a ritmo muy suave, a bajas pulsaciones, para ante cualquier síntoma, y después de todo esto, si ya estás sin medicación, progresivamente retomes tu actividad habitual.
Ánimo y suerte, ya verás que esto no es más que una chinita en el zapato.