Cuando tienes mucha experiencia, sabes como vas sin tener que tomarte las pulsaciones constantemente, y, efectivamente, casi sin mirar el crono; pero para eso hay que haber entrenado mucho controlandose, en mi opinión.
Respecto a calcular por tiempos, hay que tener en cuenta que, por ejemplo haciendo series de 100, no siempre se hace el mismo tiempo yendo a la misma intensidad; depende del estado de forma, del periodo de la temporada en que nos encontremos, etc. Así que unas veces puedes ir a 1.25 al 80%, y otras veces puedes ir a 1.20, o a 1.30, a dicha intensidad.