Hola.
Pues puede ser por varias causas.
Mira a ver si en la entrada de cada brazo pasas demasiado al lado contrario. Toma por ejemplo como referencia la línea hombro del brazo que hace la entrada. Si lo llevas demasiado al lado contrario, el cuerpo se va con él, y así ocurriría lo mismo en la otra entrada.
Puede ser también porque en la fase propulsiva realizas un empuje del agua demasiado lateral, sobre todo si es exagrerado hacia la parte interior. Acuerdate que toda fuerza que realices en el agua produce un empuje del agua en sentido contrario. Si tú empujas demasiado a la derecha, el agua te empuja a la izquierda.
Tam bién el posible que lo pies no estabilicen bien si lo mueves poco, pero aún si moverlos no debieras serpentear mucho si la dirección de la brazada bajo el agua es buena.
Observate la brazada cuando nadas, en la entrada y en la fase de tracción. Ve modificando la trayectoria y oberva qué ocurre.
Espero que eso te ayude, si es ese el problema, claro.