La verdad no tengo mucha idea de xq pasa eso pero yo que tu sigo nadando un tiempo mas. Quizas sea xq no estabas acostumbrada a hacer el ejercicio y cuando comenzamos a ejercitarnos luego de un largo período nos duele hasta el pelo.
También puede pasar que te exijas demasiado. Yo te aconsejaría que nades suave, sin tensionarte y sobre todo el estilo espalda. También te vendría bien hacer el estilo inglesa, es decir, espalda pero moviendo los dos brazos al mismo tiempo. Funciona para destensionarme!
Suerte!