La mejor respuesta te la va dar tu médico. Aquí, en el foro, solo te daremos opiniones más o menos acertadas, y esta es la mía.
Por lo que cuentas, entiendo que más que un atragantamiento, lo que te ocurre es un espasmo de la glotis o espasmo laríngeo. El atragantamiento es la obstrucción de las vías respiratorias con algún tipo de alimento de tamaño superior al que puede pasar por la tráquea.
El espasmo de la glotis es una respuesta automática e involuntaria de los músculos de la glotis (un reflejo vegetativo) normal en las personas. Este reflejo impide que, por accidente, pasen a la vía respiratoria líquidos o sólidos al quedar bloqueada la glotis, produciéndose la obstrucción de las vías respiratorias.
Este tipo de reflejo puede pasar en distintas circunstancias, entre otras, por una reacción alérgica, un traumatismo, una situación de ansiedad, hablar mientras se come o por tragar agua en la piscina o en el mar, que creo que es tu caso. Generalmente este trago se produce en el momento que vas a tomar aire, con la boca muy abierta, por lo que entra mucho agua y se produce el bloqueo. La sensación de asfixia es muy intensa y angustiosa por un breve periodo de tiempo. Procura mantener la calma hasta que esos músculos se relajen y el reflejo cese.
De cualquier manera si estás preocupado, consulta con tu médico.
Un saludo.